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Py学习  »  Python

Python环境配置保姆教程(Anaconda、Jupyter、GPU环境)!

happy科研 • 2 年前 • 277 次点击  
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作者:吴忠强,东北大学,Datawhale团队成员

1. 写在前面

搞算法的同学也都明白,一个比较完美的python环境是多么的重要。这篇文章打算把一些必备的python环境配置过程记录下来,这样不管是新到了公司实习或者就职,还是新换了电脑,都可以借鉴这篇快速把环境搭建起来啦 😉

由于我也是重装了系统,所以算是从0开始搭建python环境,这次从anaconda安装开始, 然后到cuda的相关安装配置,再到cudnn的安装配置,然后从anaconda中建立虚拟tensorflow和pytorch的虚拟环境,再各自的虚拟环境里面安装jupyter notebook并完成配置,安装tensorflow的GPU版本和pytorch的GPU版本。这一整套下来,在自己机子上做一些简单的模型实验就没有问题了。

虽然这套流程是目前是在Windows上做的,但具有普适性,在Linux上也是一样的道理,只不过有些地方的操作可能不一样,原理都是一样的。

内容包括:

  • Anaconda的安装与常用命令小总
  • Jupyter的安装与相关配置
  • CUDA与Cudnn的安装(GPU支持必备)
  • 建立tf虚拟环境并安装tf2.0GPU版本
  • 建立pytorch虚拟环境并安装pytorchGPU版本

Ok, let’s go!

2. Anaconda的安装与常用命令

Anaconda是为方便使用Python而建立的软件包,其包含250多个工具包,多版本的Python解释器和强大的虚拟环境工具,所以Anaconda是Python的全家桶。Anaconda可以使安装,运行和升级环境变得更简单,所以初步学习Python,这一个就足够了。

Windows下的Anaconda安装,是所谓的傻瓜式安装,Linux下面的安装,可以参考我之前整理的(https://zhongqiang.blog.csdn.net/article/details/112376293)

  • Anaconda官网下载安装包
  • 下载之后,点击Anaconda3-2019.07-windwos-x86_64.exe这个安装文件进行安装,选择路径,勾选加入环境变量,等待安装完成即可(这些和普通软件安装一样,一路回车操作),
  • 这里面一定注意,不要把anaconda装到C盘。因为你后面会有好多个虚拟环境,安装很多包;另外,建议把conda命令加入到环境变量里面去。
  • 验证安装成功:打开命令行,输入conda,回车。看是否能进入conda环境。

这个安装比较简单,不过多整理,下面是常用的命令,这些记好了之后,就能比较轻松的用anaconda管理虚拟环境,管理相关包了。打开命令行,输入activate, 此时会进入一个root的默认虚拟环境, 如下:
这个是一个默认的虚拟环境,如果不想建其他环境,比较省事的方法就是把所有用到的包全安装到这里面,打造一个万能环境,所以下面先整理关于包管理的命令




    
# 列出当前环境下安装的包, 非常常用
conda list

# 实验过程中,如果发现某些包没有,直接安装
conda install package_name  # 也可以带版本号
pip install package_name

# 如果发现装错版本了,想要卸载掉包
conda remove package_name
pip uninstall package_name

# 更新包
conda update package_name

在一个虚拟环境里面,掌握这几个常用的命令即可,上面是比较省事的方法,只有一个环境,但我不太习惯这样做,我一般喜欢建立多个虚拟环境,在每个虚拟环境下安装特定的包去完成相应的实验,因为有的项目可能需要python2,有的需要python3,有的可能是tf项目,有的可能是pytorch项目。这时候,用到的包会很不一致,所以,分类管理也是一个不错的思路。那么下面就是管理环境常用的命令:

# 查看已经有的虚拟环境 常用
conda env list

# 新建虚拟环境 可以指定python版本和一些包的版本
conda create -n env_names package_names   # conda create -n tfenv python=3.7

# 进入虚拟环境,这时候面临着对一些包的操作,就是上面包的相关命令了
activate tfenv

# 离开虚拟环境
deactivate

# 删除虚拟环境
conda env remove -n env_name

这里单独拎出一个东西来,叫做共享环境,这个其实是非常有用的,它能让其他人安装项目中使用的所有包,并确保这些包的版本正确。比如开发了一个系统,让别人来部署,但其他人可能不知道用的哪个python版本,哪些包等,盲目安装又可能由于版本原因出现问题,所以共享环境就比发挥威力了。怎么用?

# 将当前环境下安装的包保存为YAML文件
conda env export > environment.yaml

此时在当前目录下就会发现一个导出的环境文件:


在GitHub上共享代码时,我们往往会看到这样的操作,一般人家都会给出创建环境的文件,这时候,我们git clone下项目之后,依赖这个文件就能轻松安装依赖项。那么导出的环境文件如何使用呢?

activate tfenv

# 安装所有包
conda env update -f=/path/to/environment.yaml    

如果不用conda,而是用pip的时候,可以导出一个txt文件,然后安装:

pip freeze > requirements.txt  # 导出文件

# 然后将该文件包含在项目的代码库中,其他项目成员即使在他的电脑上没有安装conda也可以使用该文件来安装和我一样的开发环境
pip install -r /path/requirements.txt

关于anaconda,就整理这么多,应该是够用啦,后续如果有新大陆,还会再补充。

3. Jupyter的安装与相关配置

关于jupyter, 在安装了anaconda, 默认的root环境下会有jupyter notebook的,但是新创建了虚拟环境之后,我们还需要重新安装jupyter notebook。命令很简单:

pip install jupyter notebook

安装jupyter很简单,这里想整理一个事情,就是修改默认的工作空间,在Windows上使用jupyter notebook不像Linux,Linux是在哪个目录下启动,就会默认哪个目录为工作空间,但是Windows中不是这样,那么怎么修改默认工作空间呢?

这个一般是修改jupyter的配置文件,如果没有,就打开命令行,通过下面命令生成:

jupyter notebook --generate-config

此时会在C盘user下面的.jupyter目录下面产生一个jupyter_notebook_config.py的文件:


用Notepad++打开jupyter_notebook_config.py,找到c.Notebook,建立你的新工作路径,取消注释,c前面的#要去掉。
点击保存,这下就修该好了路径,cmd,输入jupyter notebook,你就发现你的路径已更改


这样一般是能够修改路径的,如果还没有,搜一下添加下环境变量,再修改下快捷方式。

修改配置文件,不仅可以修改默认工作空间,还能修改默认启动浏览器,想到想用的浏览器路径,然后打开jupyter_notebook_config.py 找到App.browser = '',在这行下面添加以下三行代码:




    
import webbrowser
webbrowser.register("chrome",None,webbrowser.GenericBrowser(u"C:\ProgramFiles (x86)\Google\Chrome\Application\chrome.exe"))
c.NotebookApp.browser = 'chrome'

此时就修改了jupyter使用的默认浏览器。

在这里插入图片描述

关于jupyter的配置就整理这么多,但是原生的jupyter可能不是很好用,此时可以安装一些扩展功能:

conda install -c conda-forge jupyter_contrib_nbextensions

此时,打开jupyter就会有一些扩展功能:


这个还是非常强大的,可以对各种单元格加一些骚操作等。

另外,这里也记录一个我比较喜欢的jupyter一个主题:

pip install jupyterthemes

# 一个不错的主题
jt -t monokai -f fira -fs 13 -cellw 90% -ofs 11 -dfs 11 -T -N

下面整理些jupyter单元格操作的快捷键:

执行当前cell,并自动跳到下一个cell:Shift Enter
执行当前cell,执行后不自动调转到下一个cell:Ctrl-Enter
是当前的cell进入编辑模式:Enter
退出当前cell的编辑模式:Esc
删除当前的cell:双D
进入下一个cell:双A (前面)或 Alt+Enter(后面)

为当前的cell加入line number:单L
将当前的cell转化为具有一级标题的maskdown:单1
将当前的cell转化为具有二级标题的maskdown:单2
将当前的cell转化为具有三级标题的maskdown:单3

为一行或者多行添加/取消注释:Crtl /
撤销对某个cell的删除:z
浏览器的各个Tab之间切换:Crtl PgUp和Crtl PgDn
快速跳转到首个cell:Crtl Home
快速跳转到最后一个cell:Crtl End

ctrl + ?         #注释
shift + tab      # 查询函数的注解

# jupyter 将本地.py文件导入
%load test.py #test.py是当前路径下的一个python文件

# 运行python文件
%run file.py
!python myfile.py

4. Cuda和Cudnn的安装

CUDA是一个并行运算的一个计算平台,而CuDNN是在上面的一个深度神经网络的GPU加速库。如果想用TensorFlow或者pytorch的GPU版本,这两个是必须要安装的。但前提,机子内得有显卡,且是NVIDIA的。

4.1 Cuda安装

下载CUDA,这个是cuda-10.0的版本,如果安装别的版本,也可以在这里找。

链接:https://developer.nvidia.com/cuda-10.0-download-archive?target_os=Windows&target_arch=x86_64&target_version=10&target_type=exelocal

下载完成后,打开下载的驱动, 开始安装。这里选择自定义安装:

自定义安装这里可以进行一些设置,否则有可能会导致安装失败,首先组件这里取勾GeForce Experience,


然后, 我这里安装的时候,必须Visual Studio Integration也需要取消勾选。

点开Driver comonents,Display Driver这一行,前面显示的是Cuda本身包含的驱动版本是411.31
如果你电脑目前安装的驱动版本号新于Cuda本身自带的驱动版本号,那一定要把这个勾去掉。否则会安装失败(相同的话,就不用去取勾了)


接下来就等他安装完成即可。

结束之后, 怎么看是否成功了呢?打开下面这个路径,查看nvcc.exe,有这个说明CuDA安装成功。


打开此文件夹,查看有没有cuti64_100.dll


有这个cuti64_100.dll就说明CUPT1已成功。

4.2 Cudnn安装

同样的,来官网: https://developer.nvidia.com/rdp/cudnn-download, 选择Cudnn for CUDA10.0, 这个需要登录, 注册个邮箱或者用微信登录即可。

下载下来之后,解压cuDNN:


将解压后文件复制到CUDA文件夹下


接下来,要配置环境变量,

我的电脑——>属性——>高级系统设置——>环境变量

在系统环境变量中找到path

当安装完Cuda的时候,会自动的cuda的bin目录以及libnvvp目录加入到环境变量中,但是并没有加CUPA和Cudnn的路径,我们需要把这俩加入进来,这样,在使用TensorFlow的时候,才不会报错。


Cudnn和Cupta的路径缺一不可,第三个不用管,安装anaconda的时候,会自动加入。

测试cuda, 打开命令行, 输入nvcc \-V


这里会显示版本。

5. 建立tf虚拟环境并安装tf2.0GPU版本

这里主要是tf2.0GPU版本的安装, 有了上面的铺垫,这里会变得非常简单。

首先,先建立一个tfenv的虚拟环境:

conda create -n tfenv python=3.7

此时,我这里竟然报了一个错误:

CondaHTTPError: HTTP 000 CONNECTION FAILED for url <https://mirrors.tuna.ts

这个我一开始以为是我anaconda换了安装目录导致的,但经过查阅资料,应该是源的问题,anaconda换源后无法创建新的虚拟环境。我的解决办法:

找到这个.condarc文件,这个在我的C:\Users\ZhongqiangWu目录下面,把https改成了http就好了。

这样就能创建出tfenv的虚拟环境,然后激活activate tfenv,进入环境。

// 安装TensorFlow-gpu
pip install tensorflow-gpu=2.0.0-beta0

此时等待下载,进行安装即可。安装完毕之后,测试是否安装成功。

在当前环境下,输入python进入环境,然后:




    
import tensorflow as tf
print(tf.test.is_gpu_available())   // 如果输出True,说明安装成功

但在我这里,导入TensorFlow的时候,报了一个错误:

ImportError: Could not find 'cudart64_100.dll'
TensorFlow requires that this DLL be installed in a directory that is named in your %PATH% environment variable

这个通过查资料,大部分得出的结论是这篇文章说的那样, 即cuda版本的问题, 这里会发现100,这其实意味着cuda要用10.0版本的,因为安装完cuda的时候,会在cuda的bin目录下面有这么一个dll文件:


也就是TensorFlow在导入的时候,会去找有没有这样的一个文件, 当然我这里tf2.0找的是10.0的这个,可能有的报错说找不到101.dll或者102.dll这种,这显然是cuda版本不匹配,要卸载掉当前的cuda, 重新安装对应版本的,或者卸载掉当前版本的tf,重新安装个别的版本的tf。但有种做法不提倡,有的竟然硬性的把这里的100.dll修改名字,改成101.dll这样,这叫投机取巧,并不是在解决问题。

我当时就非常纳闷, 我这里明明有这个文件,并且我也把这个bin目录加入到了环境变量里面,为啥还会报上面的这个找不到这个文件的错误呢?其实是费了一些时间的,网上也没找到好的办法,最后,我想到,可能是因为我anaconda启动的原因:

我anaconda这次安装到了D盘里面,然后依然是借助Anaconda Prompt启动了命令行,然后进入的虚拟环境。此时,我再想一个问题,我在虚拟环境里面输入python,然后import tensorflow的时候,此时tensorflow去找依赖的时候,是去哪里找呢?


怎么保证它这里是找的环境变量里面的配置呢?好像并没有进行设置,所以我猜测,它这里找dll的时候,可能是D:\Anaconda3\envs\tfenv\Library\bin目录下去找相关的dll文件,如果找不到,可能不会自动的去总的环境变量里面找,就直接报错了。


这个启发来自于,如果我们通过anaconda3自动安装cuda和Cudnn的时候,此时cudart64_100.dll是在D:\Anaconda3\envs\tfenv\Library\bin目录下的。而上面我们并没有通过anaconda3安装这俩哥们,而是手动安装的,那么在anaconda 自己的命令行里面可能找不到。

所以关于这个问题,我最终的解决办法,就是不用anaconda prompt启动命令行进虚拟环境,而是直接cmd打开系统的命令行,然后直接输入activate,进入root的环境,然后activate tfenv进入到虚拟环境,此时再运行测试,发现成功。这个应该是走环境变量里面的文件了。


此时,tf2.0的GPU版本安装成功。

6. 建立pytorch虚拟环境并安装pytorchGPU版本

这里和上面就基本上是一样的过程了,这里是按照pytorch的GPU版本,首先是建立虚拟环境

conda create -n pytorch_gpu python=3.7

此时,又出现CondaHTTPError: HTTP 000 CONNECTION FAILED for url, 真是服了, 此时我重新配置.condarc,修改成下面这个样子:

channels:
  - http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
  - http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
  - http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
  - http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
show_channel_urls: true

把vpn关掉,然后好使了。

接下来安装torch和torchvision, 进入下面这个网站: http://download.pytorch.org/whl/torch_stable.html, 找符合系统版本、cuda版本的torch,采用搜索的方式找


我的是cuda10.0, python3.7版本,win10系统,64位。下载下来。

torchvision同样的道理,把这两个.whl文件下载下来。然后回到命令行, 安装即可。

pip install "torch-1.2.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl"
pip install "torchvision-0.4.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl"

安装完毕,进行测试,依然是进入python环境,然后输入:


这样,pytorch的GPU版本安装完毕!

有了这一整套流程,在自己机子上搭建python环境,跑模型实验,就比较方便啦,不管是tf项目还是pytorch项目,都能用这一套环境实验。Linux上其实也是这样的流程,很多地方都是一样的,原理都是通的,无法就是配置环境变量的时候不太一样。

参考:

之前整理的文章链接也放过来:

  • 大数据环境搭建下面的anaconda搭建

    https://zhongqiang.blog.csdn.net/article/details/112376293

  • Python管理包工具anaconda安装过程常见问题解决办法

    https://zhuanlan.zhihu.com/p/34337889

  • Python·Jupyter Notebook各种使用方法

    https://blog.csdn.net/liuyanlin610/article/details/76231958

  • 远程连接GPU服务器上的jupyter notebook解决方案

    https://blog.csdn.net/wuzhongqiang/article/details/107555363

  • Windows下GPU版本详细安装教程

    https://cloud.tencent.com/developer/article/1458665)

  • Windows下的Pytorch环境手把手搭建

    https://zhongqiang.blog.csdn.net/article/details/104503860


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