本周“一作论坛”为组学篇,时间是4月1日20:00-21:00,由麻省理工学院博士后邱肖杰报告,题目为:超越RNA速率:机器学习方法,dynamo,从单细胞测序数据学习完整细胞动力学模型,届时欢迎大家参加直播。
20:00-20:30 邱肖杰《超越RNA速率:机器学习方法,dynamo,从单细胞测序数据学习完整细胞动力学模型》邱肖杰:邱肖杰博士是麻省理工学院Whitehead研究所,美国科学院院士Jonathan Weissman 实验室的博士后研究员。他的工作专注于应用新的单细胞基因组学技术(包括新的基于代谢标记的单细胞测序或空间基因组学)和构建新的计算框架来了解细胞的命运,并预测和操纵它。肖杰在华盛顿大学,单细胞测序领域先驱Cole Trapnell的指导下攻读博士学位。肖杰的博士工作对单细胞基因组学领域做出了重大贡献,例如他开发的Monocle 2/3,可以准确、稳健地重建复杂的发育轨迹来深入分析scRNA-seq 数据。这些工具成为了单细胞测序领域用的最多的工具之一。与 Sreeram Kannan 密切合作,他还开发了 Scribe从单细胞时间序列数据集中检测直接因果关系的基因调控关系。他最近的工作包括与邢建华实验室紧密合作开发的dynamo(https://github.com/aristoteleo/dynamo-release)超越传统的计算框架单细胞的的预测建模细胞命运转变,以及与华大基因紧密合作对大视场,高精度空间基因组学的stere-seq建模研究。扫描二维码或点击【阅读原文】链接注册,通过邮件和手机查收腾讯会议号码,与一作同频直播,提问环节可开麦与作者直接对话。(该会议为周期会议,注册一次保存后可快速加入每周五一作论坛,无需重复注册)点击下方视频号预约按钮,可更加方便的观看直播,并会在微信端接收到直播开始提醒。由于微信视频号观看人数较多刷屏很快,且没有记录功能,提问可能会被刷掉,通过视频号观看直播的观众欢迎扫描二维码加入微信群,在直播前或者直播后持续与作者沟通。
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