计算模拟+高端表征能够深入解释实验机理,提升论文档次,已成为顶刊标配。
LAMMPS作为功能最强大、应用最广范的分子动力学软件,可以实现对百万级原子分子体系的计算,是入门分子动力学的首选。
6小时LAMMPS特训营,针对零基础小白,完全免费!四大专题直接搞定高熵合金摩擦模拟、纳米压痕、聚合物模拟、交联接枝、层状聚合物建模/测试!
包括LAMMPS+Python+OVITO+Materials Studio+VMD课程视频、 核心错误讲解、拿来即用脚本。
第一期:3种LAMMPS的结构建模方法
1. 多晶中熵合金的建模;
2. 如何构建中熵合金CrCoNi分子模型;
3. 如何构建不同的纳米压头结构;
4. 摩擦力和摩擦系数的获取;
5. Python入门简介;
6. 结合MDAnalysis软件包讲解LAMMPS的分子动力学轨迹分析方法,并对LAMMPS分子模型进行前、后处理。
中熵合金的多晶建模:
摩擦过程:
中熵合金CrCoNi+纳米压头模型(OVITO和VMD不同渲染软件):
纳米压头的初步下压(不同的初始压入深度):
第二期:聚合物建模+LAMMPS分子动力学模拟+分析方法
1. Materials Studio建模聚合物分子链;
2. CHARMM-GUI建模聚合物分子链;
3. Python生成随机分布的amorphous聚合物初始结构;
4. 聚合物的分子动力学模拟:包括软势,退火,动力学;
5. 采用Python和MDAnalysis对轨迹进行性能分析:包括MSD(和扩散系数有关),拉伸力学性能,和拉伸过程中链取向。
Python+MDAnalysis随机填充构建聚合物薄膜:
CHARMM-GUI建模聚合物:
LAMMPS应力应变曲线:
LAMMPS链取向分析:
第三期:VMD+Python建模+LAMMPS分子动力学模拟+分析方法
1. VMD软件构建石墨烯粗粒化模型,及设置势函数;
2. Python MDAnalysis建模石墨烯表面的UA聚乙烯接枝,指定接枝密度和接枝长度;
3. 构建聚乙烯和石墨烯的层状复合材料;
4. 模拟聚合物的末端可逆交联;
5. 探究交联反应对拉伸力学性能、聚合物链取向的影响。
VMD建模:聚乙烯UA模型和石墨烯粗粒化模
Python MDAnalysis建模:聚乙烯/石墨烯层状复合材料模型
可逆交联:聚乙烯末端交联反应(愈合)
第四期:OVITO+Python建模+LAMMPS分子动力学模拟+分析方法
1. MS软件构建聚乙烯(PE)和聚苯乙烯(PS)的全原子模型及设置势函数(CVFF);
2. LAMMPS中Lennard-Jones势函数详解,cutoff的作用以及如何在平衡过程中巧妙利用它来平衡结构;
3. Python建模PE/PS层状聚合物聚合物模型;
4. 层状聚合物的bulk体系模拟、thin-film模拟;
5. 模拟中反射墙的用法;
6.利用LAMMPS计算一维、二维密度分布,以及体系内不同组分的单独MSD曲线。
分子模拟中非键相互作用Lennard-Jones势函数详解:
反射墙下体系压缩获取层状结构(原子限域盒内):
OVITO-Python:不规则界面面积与界面能计算
PE/PS的MSD与薄膜密度分布计算:
王老师:华算科技LAMMPS授课老师,拥有八年以上LAMMPS软件使用经验。目前于德国达姆施塔特工业大学进行博士后工作。
发表SCI共15篇,其中包含6篇Macromolecules文章,并参与编著英文书籍《Fundamentals of Multiscale Modeling of Structural Materials》。
主要研究领域为:利用分子动力学模拟方法:① 研究金属(梯度和中、高熵合金)及其纳米复合材料的力学性能;② 开发高分子和石墨烯的粗粒化模型,并研究高分子及其纳米复合材料的结构、构象,动力学,力学和导电性能。
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