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基于常规临床数据利用机器学习预测肝细胞癌风险:一项基于人群的大型多中心研究

医脉通 • 昨天 • 24 次点击  

肝细胞癌(HCC)是全球高发且致死率极高的恶性肿瘤,当前临床筛查多以肝硬化为主要纳入标准,但肝硬化起病隐匿、漏诊率高,加之代谢相关脂肪性肝病相关HCC占比持续上升,现有筛查方案的覆盖范围与精准度均存在局限,亟需更经济普惠的高危人群识别工具。近期发表于《Cancer Discovery》的一项研究[1],依托英国生物样本库(UKB)与“All of Us”研究计划(AOU)两项大规模人群队列(合计覆盖超90万人群、983例HCC病例),开发了基于常规临床数据的可解释机器学习(ML)风险分层模型PRE-Screen-HCC,无需依赖肝硬化前置诊断,旨在提升HCC早诊率,拓展筛查可及性,改善肝癌患者预后。




UKB中的HCC病例可代表普通人群特征




研究纳入UKB的538例、AOU的445例HCC病例,其发病率均与对应国家本土流行病学数据相符。数据显示仅31%的患者确诊前有慢性肝病诊断记录,近三成患者始终未检出慢性肝病,漏诊问题突出,因此研究采用二分类结局作为核心建模终点,可靠性更强。


为适配不同验前概率,研究设置全人群与高危人群两个分析队列,系统筛选并验证了人口学、生活方式、代谢组学等多模态特征与HCC的显著关联,为后续模型构建提供了特征基础。


图1 UKB涵盖具有代表性的HCC风险因素[1]


表1 按性别与HCC患病状态分层的UKB研究人群基线特征[1]


表2 按性别与HCC患病状态分层的AOU研究人群基线特征[1]




分步研究架构模拟真实世界环境中的数据可用性




研究围绕人口统计学、电子健康记录、血液检测、基因组学、代谢组学5种数据模态,分别以单模态独立评估、分步纳入模拟临床可及性两种方式建模,在全人群与高危人群两个队列中共构建20种模型变体。


模型基于UKB英格兰地区中心数据训练,采用五折交叉验证调参,预留其余4个中心作内部测试,同时以AOU队列开展外部验证。经多算法对比,选定性能最稳定的ML模型——随机森林分类器(RFC),通过网格搜索确定轻量化参数,规避过拟合风险。




ML在预测普通人群HCC发生风险方面优于线性风险评分




研究以表现最优的传统线性评分aMAP为基准对比验证ML模型的HCC预测效能。单模态分析显示血液参数预测价值最高,基因组学最低;多模态整合后性能进一步提升,仅纳入人口学、诊断信息与血液数据即达性能平台(AUROC 0.88),新增组学数据增益微弱。


针对低发病率带来的数据不平衡场景,ML模型精确率较传统评分提升3~10倍,假阳性数量大幅减少;组学数据仅对极高危人群有小幅增益,常规筛查场景价值有限。


图2 预测指标[1]




可解释性方法可凸显HCC的已知风险因素




研究通过特征消融逐步精简模型,最终发现TOP 15模型与TOP 30模型的性能无显著差异,且均优于传统评分。验证显示,模型性能增益主要源于特征的选择与组合,而非单纯的非线性建模架构。而且特征重要性分析与临床共识高度一致:血液类指标贡献度最高,模态层面血液数据价值最大,基因组学增益可忽略,基线甲胎蛋白单独预测HCC的能力有限。




适用于HCC风险评估的可操作风险评分和风险等级分类




为使连续风险评分具备临床可操作性,研究完成模型概率校准,确保预测值贴合真实发病风险,同时建立三级风险分级体系,设置“纳入/排除筛查”双决策阈值。


验证显示,超70%的HCC病例被归入高危组,中高危组合计覆盖近88%的病例,阴性预测值表现优异;受疾病低发病率的客观局限,假阳性病例较多。模型效能随时间衰减幅度小,风险分层的发病差异早期即可显现,女性人群假阴性率相对更高。

图3 HCC风险预测模型的可解释性[1]




适用于HCC风险分层的可推广模型




研究在AOU独立队列(共12.3万余名受试者,含445例HCC)中开展外部验证,采用准前瞻性设计,分三个5年时间窗口评估模型对5年发病风险的预测效能。结果显示,所有ML模型性能与UKB测试集表现相当,且均显著优于传统线性风险评分,证实其具备跨队列泛化能力,排除了过拟合可能。不同人群的预测分值存在差异,提示临床应用需结合本地疾病负担调整阈值;模型在不同种族亚群中表现均衡,性别带来的性能差异有所缩小,特征规律与校准效果均可良好迁移。

图4 ML模型可泛化至独立人群[1]


研究结论


本研究首次系统对比了HCC预测中不同数据模态的独立价值,证实基于常规临床数据构建的可解释的ML模型,可实现精准的人群层面HCC风险分层,性能显著优于现有公开风险评分。研究遵循TRIPOD规范,采用地理拆分内部验证与独立外部队列的双重验证设计,结论可靠。同时揭示了当前筛查流程的核心缺口,肝硬化仅适合作为筛查纳入指标,无法有效排除低危人群。目前模型存在女性漏诊率偏高、病毒性肝炎高发人群验证不足等局限,临床落地仍需前瞻性试验进一步验证,未来可作为低成本预筛查工具拓展HCC筛查覆盖范围。


参考文献

[1] Clusmann J, Koop PH, Zhang DY, et al. Machine Learning Predicts Hepatocellular Carcinoma Risk from Routine Clinical Data: A Large Population-Based Multicentric Study. Cancer Discov. 2026 Jul 1;16(7):1304-1322.


审批编号:CN-194077

有效期:2027-09-06

本材料由阿斯利康提供,仅供医疗卫生专业人士参考,不用于推广目的。若涉及具体药物使用,请参考相关药物说明书,阿斯利康不建议您将产品超说明书使用。


撰写:Rosewei

审校:Arrival

排版:Jin

执行:Atai






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