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代码公开!复旦大学冯建峰团队“高分收割机”,挖掘UKB数据库,基于机器学习的预后模型构建,这样做还怕发不了高分?

生信塔 • 6 月前 • 453 次点击  

代码公开!复旦大学冯建峰团队高分收割机”,挖掘UKB数据库,基于机器学习的预后模型构建,这样做还怕发不了高分?

嗨喽~大家好,智星在实验室忙碌了一天,终于抽出一点时间给大家分享文献啦!不知不觉2024年快过完了,大家的SCI有没有成功发表?实验是否顺利?不管你是还没有发文思路的医学小白,还是手拿几篇高分SCI的临床大佬,都可以来智星这里开阔思路,说不定就灵感爆发呢?毕竟学无止境,快来看看今天智星带来了什么好文章吧!

本篇是由复旦大学冯建峰团队发表于“Neurology(IF 7.7),作者结合机器学习算法,开发了一个基于血浆蛋白和临床-人口学变量的帕金森病高风险预测模型,极大提升了帕金森病的预测效果,并且代码公开!想复刻该思路的小伙伴们可以来学哦~

2024年的进度条已拉过大半,仅仅凭借常规的分析就想在1区高分段发表文章,显然已经非常吃力,只有不断在思路上进行创新,才能脱颖而出!现在开始行动还不晚,有想法的小伙伴们快点迈出第一步,智星这里有专业团队可以帮您设计课题和方案,各种生信分析也不在话下哦~

l题目:血浆蛋白结合临床人口学指标预测未来帕金森病

l杂志:Neurology    

l影响因子:IF=7.7

l发表时间:2024年7月

请前往文末获取文献DOI哦~

研究思路

本研究首先通过挖掘英国生物样本库(UK Biobank,UKB)和帕金森病进展标志物计划(PPMI)数据库,使用血浆蛋白质进行分析,基于机器学习算法,筛选重要蛋白质,并构建帕金森病高风险预测模型。流程图如下所示:

图1

主要结果

1、表1 显示了人群特征:    

表1

2、图2预测器的预测性能和SHAP值反映了对未来PD风险的预测。    

图2

3、将预测的PD风险分层分为高风险组和低风险组,分层风险组的Kaplan-Meier图如图3所示。    

图3

4、PDRP中预测因子的时间趋势如图4所示。

图4

文章小结    

本研究使用机器学习算法,结合血浆蛋白和临床-人口学变量,识别帕金森病高风险人群,极大提升了帕金森病的预测效果。动动手指,足不出户就能收集跨越时间、空间的样本数据,结合自己的课题方向,稍加分析,一篇5-10SCI就能到手!心动不如行动,来找智星,以最省钱的方式为你设计最适合自己的方案!

智星有话说

智星提供思路设计、定制生信分析、文献思路复现;有需要的小伙伴欢迎直接扫码咨询,竭诚为您的科研助力!

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原文链接:https://doi.org/10.1212/WNL.0000000000209531

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本文地址:http://www.python88.com/topic/175069
 
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