单细胞数据分析炙手可热，python在单细胞分析里占据的地位也越来越高。因为很多工具是基于python原生态开发的，而且在Python编程环境下运行速度会是R编程语言的10倍以上。 比如转录因子分析，它作为单细胞的3大高级分析，大家应该是不再陌生，我们也多次介绍过：
因为在R里面跑这个，超级耗时，所以我们也介绍了Python版本： 使用pyscenic做转录因子分析 和 没想到自己会放弃conda（docker镜像的pyscenic做单细胞转录因子分析） ，大家可以按需取用。
也就是说，仅仅是会R编程语言有时候会对部分高级分析望洋兴叹，而且大量的高分文献在公布他们的代码在github的时候我们也可以很明显的看到必须是R和Python两手抓了，比如2024的NC文章：《Single-cell and spatial transcriptomics analysis of non-small cell lung cancer》的代码就是：
所以该上手python单细胞系统学习的课程啦！
暑期课程和前两期课程的区别 去年年底和今年年初，我们已经开办了两期python单细胞课程。经过之前的积累，我们已经：
(1)系统的linux基础。
(2)单细胞10x数据上游分析。 (3)RNA velocity 上游分析。
(4)python基础部分增加了练习题和作业。
(5)单细胞实战数据案例(面向学员征集)。
(6)python和R语言的对接和数据转换。
(7)更多实用的学习方法、解决问题的思维、AI工具玩法等。
2. 准备好了 详实、友好的学习资料、示例数据和代码、练习和文档等 。 3. 配置好的、可以自由复制到自己电脑上的 python环境、包库版本+完整代码的jupyter notebook资料 ，是满满的诚意，真心要教会你！4. 收集了常见问题文档 ，学习不可能不遇到问题，我们要学会面对问题并解决问题呀。5. 团队成员们以文字、图片、语音、拉小群沟通和远程控制等多种方法为大家解决疑难问题，参与往期课程的同学们也积极沟通和讨论，互帮互助。团队积累了更多解决问题的经验 ，可以更好地为大家保驾护航！ 随便截了几张图，只是我们幕后工作的冰山一角：
(注:截图中有提到服务器，并不是必须的)
📅 课程时间
7月5日开始，钉钉线上互动直播课，共12次课。
7月5日(周六)和7月6日(周日)，前2节课程的上课时间是 上午9：30~12:00
后面的10节课上课时间是 晚上8:00-10:30
🎯 课程目标 掌握单细胞数据分析的全套流程，可以独立分析自己的数据。 具备进阶分析和自定义需求的探索自学能力，和解决问题的能力。 💪 基于Python分析单细胞数据的优势 多平台兼容 ： 在win、mac和linux系统上均可使用计算效率高 ： 比起R语言更省计算资源，自己的电脑可以处理更大的数据，计算速度快，效率高。可以和R语言结合使用 ： jupyter notebook里面可以嵌入R语言的脚本，如果你熟练使用R语言，分析结果可以转换为R语言可读取的格式，用R语言的ggplot2画图；也支持读取R语言的Seurat的结果进行后续分析。gpt很会python ： gpt降低了我们的学习成本，写Python的代码正确率高。可扩展性更强 ： 很多单细胞数据分析的新工具是基于python开发的，还可以衔接Python强大的机器学习和深度学习工具，进阶分析有无限可能！📚 课程大纲 第1课：linux基础与Python环境搭建 第2课：基于linux 的单细胞上游分析 第3课：Python编程基础 第4课：Python数据处理 第5课：数据可视化 第6课：Python进阶 第7课：单细胞数据分析基础 第8课：单细胞数据注释与可视化 第9课：多样本整合和注释 第10课：富集分析和拟时序
第11课：单细胞实战数据案例 第12课：高级分析和文章复现 📢 后续学习和答疑 课程结束后 半年内 微信群会继续提供 课程答疑 （答疑结束后学员群也不会解散，继续给大家分享学习资料），还有每月一次的 讲师直播答疑 哦，不限参与次数和时间，我们偶尔有2020年的学生都还可以参与直播答疑呢，大多数人出师了已经不需要答疑啦！ 我们的幕后团队正在持续输出详尽的文字版资料，介绍前沿进展和高级分析，届时大家已经具备了自学能力，打开知识的大门，一切尽收眼底！ 📷部分图表
具体的图表数量再多也是有限的，我们更注重的是帮助你搞定基础、方法和规律，授人以渔~
🎓 适合人群 生物学、医学、生物信息学背景的学生、医生和科研人员 👨🏫 教学团队 生信技能树直播课原班人马： 小洁老师、大萌老师、小苏老师 及多位经验丰富的助教，拥有丰富的教学经验和海量的资料库、智囊团！
小洁老师： 生信技能树核心成员、6年教学经验的资深全职讲师， 生信星球 公众号创办人之一（另一位创办人是她的丈夫），简书、语雀、公众号原创作者、今日头条认证优质作者， 《 解码生命》 第二版书籍编者之一，R包 tinyarray 的作者，共一发表一篇1区8分文章(International Journal of Biological Macromolecules)。自 2018 年 5 月起，在各写作平台分享了上千篇生物信息学笔记、教程，全网关注人数 7w+ ； 2018 年 8 月至今，开办了180+期新手保护 学习小组 ，指导了千余名生信小白零基础入门，十分了解初学者入门生信的障碍、心理和常见问题；2019 年1月至今担任生信技能树团队线下和线上课程讲师，主讲R语言、数据挖掘和python单细胞课程，累计
1 00+ 场，学员 7 000+ 名。课堂轻松有趣，重点明确，通俗易懂，讲练结合，给学员充分的练习和试错机会，掌握必备的数据处理、挖掘、可视化等技能、最实用的分析技巧和学习方法，广受好评。
大萌老师： 一个因为做不出实验愤而转生物信息学方向的留美博士生。机缘巧合之下在生信的道路上有了些许收获和心得。曾参与过 natur e 文章的发表，现已参与发表论文 18 篇，总引用超过 900 次。相对于院士和大佬，他更懂新手和小白面对的困难和可能遇到的问题，像一个 温柔细心的师兄 带领大家进入生信的世界。
小苏老师： 一个什么都会一点的科研工作者，坐标香港，干湿结合，全面发展。有 5 年生信数据分析经验，擅长R、python、bulk转录组和单细胞转录组，表观组学，上下游全流程分析。 “生信菜鸟团” 公众号从入门角度分享自己的学习笔记，新手友好型领路人。
助教队伍主要成员 我们的线上课程配备生信技能树强大的助教队伍，他们基础扎实、数据分析经验丰富，并多次参与线上和线下课程助教工作，全方位保障你的入门！
小郭老师：
从2019年开始承担线下课和线上课的助教工作，对于初学者遇到的各种疑难杂症拥有极其丰富的经验， 上得厅堂下得厨房，跑的了linux，玩的了单细胞 ， 2022年主讲 肿瘤外显子 课程。
小谢老师：
擅长转录组、基因组及重测序数据。正式工作后主攻 单细胞 分析方向，在“单细胞天地”平台上分享文献阅读笔记、常见图表解析及复现技巧，“生信技能树视频号”分享单细胞文献和数据集分析流程，积累多次线上线下助教经验后，成为新晋单细胞讲师，有
20+ 次单细胞授课经验。
📱 学费和报名方式 学费1999元，已包含12节课程的直播和回放、课后答疑、学习资料等所有费用。
加微信咨询，付款完成后，即可加入微信群和钉钉群，开始做准备工作，开启你的python和单细胞数据分析之旅！
python班老学员专属补课通知 已报名前两期课程的老同志们 ，课程会更新，但组织不会把你留在过去，你可以申请继续参加本次课程直播，我们提供两个方案：
1.将本文转发至朋友圈，并附带一两句推荐语，集赞18个，发给“技能树”微信。
2.如果有碍偶像包袱，不想集赞，那么可以补学费400元。
课程常学常新，欢迎和期待各位毕业生再次回到我们的课堂。
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