论文读到第三遍,荧光笔已经划满,真要复述时脑子里却只剩一句“作者效果很好”。研究问题怎么提出、方法依赖什么假设、结论对应哪张图,常常要重新翻 PDF。
99%小伙伴的做法,大概是边读边摘录,再按自己的模板整理。但论文一长,公式、图表和笔记来回切换,阅读时间很容易耗在搬运信息上。提取材料、按固定问题拆解文章、保留证据位置,再把结果沉淀成可回查的笔记。这种需要反复搬运的重复性劳动,难道不是最适合AI了吗?
今天我们向大家推荐3款 GitHub 上的高星文献精读Skill,助大家在精读文献时不再烦恼。
01 工具推荐
1 evil-read-arxiv
项目链接:
https://github.com/juliye2025/evil-read-arxiv
项目介绍:
evil-read-arxiv 是一组兼容 Claude Code 与 OpenAI Codex 的论文工作流 Skill。仓库不只做单篇分析,还包含每日推荐、顶会检索、论文图片提取和已有笔记搜索。
其 paper-analyze 会识别 arXiv、公开 PDF、本地 PDF、项目页或技术博客,再生成包含背景、方法、实验、价值、局限和相关工作对比的结构化笔记,并更新 Obsidian 知识图谱。
简易安装指南:
先安装 Python 依赖:
pip install -r requirements.txt
Codex 用户将需要的 Skill 目录复制到个人技能目录。只做文献精读时,可先安装 paper-analyze 和 extract-paper-images:
$skills = "$env:USERPROFILE\.agents\skills"New-Item -ItemType Directory -Force $skills | Out-NullCopy-Item -Recurse evil-read-arxiv\start-my-day $skillsCopy-Item -Recurse evil-read-arxiv\paper-analyze $skillsCopy-Item -Recurse evil-read-arxiv\extract-paper-images $skills
Copy-Item -Recurse evil-read-arxiv\paper-search $skillsCopy-Item -Recurse evil-read-arxiv\conf-papers $skills
mkdir -p ~/.agents/skillscp -r evil-read-arxiv/{start-my-day,paper-analyze,extract-paper-images,paper-search,conf-papers} ~/.agents/skills/
如果要把结果写入 Obsidian,还需设置 OBSIDIAN_VAULT_PATH,并按 README 准备目录与配置文件。复制后新建 Codex 任务;若 Skill 没出现,再重启客户端。
提示词范例(项目作者):
如果你想深入阅读某篇论文:
paper-analyze 2602.12345paper-analyze "论文标题"paper-analyze "https://example.com/paper.pdf"paper-analyze "https://example.com/research/project/"paper-analyze "https://example.com/blog/post/"
Codex 中显式调用:
$paper-analyze https://example.com/paper.pdf
接下来这个Skill会:
下载论文 PDF
提取图片
生成详细的分析笔记
更新知识图谱
2 DeepPaperNote
项目链接:
https://github.com/917Dhj/DeepPaperNote
项目介绍:
DeepPaperNote 专做一件事:把单篇论文变成可长期复用的 Obsidian 深读笔记。它会重建研究问题、方法链、证据、结果和图表语境,尤其强调保留公式、数值与证据边界。材料不足以支撑精读时,工作流会停下来索要更好的来源。
仓库同时支持 Claude Code、Codex、Cursor、Copilot 和 Gemini CLI。
npx skills add 917Dhj/DeepPaperNote
安装程序会让你选择需要安装的 skill,以及要安装到哪些 Agent。大多数用户可以先选择 deeppapernote;只有需要可复用术语笔记时,再选择 paper-glossary。
2. 安装核心 PDF 依赖
python3 -m pip install PyMuPDF
DeepPaperNote 需要 Python 3.10 或更高版本。核心 PDF 抽取路径依赖 PyMuPDF。
Prompt 示例(项目作者):
论文标题、DOI、URL、本地 PDF 都可以直接作为输入;也支持 arXiv ID,在具备兼容集成时还支持 Zotero 条目。
给这篇论文生成深度笔记:把这篇论文整理成 Obsidian 笔记:<论文>
DeepPaperNote 默认生成中文笔记,当前写作与校验规则也主要针对中文输出优化。
3 PaperForge
项目链接:
https://github.com/FeijiangHan/PaperForge
项目介绍:
PaperForge 把精读推向“主动质疑”。它会反推作者可能的思考路径,解释方法机制和数学推导,再检查脆弱假设、设计最小复现实验与反例,最后尝试提出后续研究方向。仓库提供中英文 Skill,也提供可直接粘贴进 ChatGPT 或 Claude 自定义指令的 System Prompt。
最省事的用法是打开仓库中的 SKILL_CHN.md,保存为目标 Agent 的 Skill;Codex 可放入个人 Skill 目录。若暂时不想安装,直接复制 System_Prompt.txt 到项目自定义指令,再上传 PDF 或发送论文链接也能运行。
Codex:将 SKILL_CHN.md 按 Skill 目录结构保存到 ~/.agents/skills/paperforge/
Prompt 示例(项目作者):
你的任务是:清晰、易懂、深入、详细的总结这篇论文(读取PDF、搜索arxiv等各种信息源获取论文)。你的总结需要条理清晰的包含下面环节:1. 论文提出并解决的研究问题是什么(适当搜索调研和补充背景)?为什么这个问题是重要的?解决这个问题能带来哪些价值?2. 这个问题之前被解决了吗?之前的研究为什么存在不足?3. 在正式讲方法之前,先重建作者可能的思考路径。这个部分不要使用论文自己的贡献作为前提,只使用论文之前已有的背景、失败模式、经验观察和相关工作。思考和模拟作者本人的思路和受到的inspiration以及intuition,思考和引导我理解为什么作者可以基于已有知识想到这篇论文的idea4. 这篇论文提出方法的Intuition是什么?易懂清晰concise的告诉我这篇论文核心idea的本质。5. 这篇论文的具体方法是什么?结合一个真实的例子讲解:输入、处理、输出完整的pipeline。分点说明,清晰易懂。6. 这篇论文的核心数学推导过程是什么(一步步从0让我从理论视角理解方法)?如果有,请给我补充理论背景(我的数学比较差),告诉我理论的基础和intuition;如果没有,可以说明并跳过这一点。所有数学公式使用准确的markdown语法确保渲染成功。7. 这篇论文是如何设计实验来验证提出的方法和claim的?按照下面格式总结:提出了什么问题->设计了什么实验验证这个问题->问题的答案是什么。不需要很多数据细节,只需要核心思路8. 总结这篇论文的take aways#【建议(注意删掉这个注释)】:如果只是想要快速理解论文,可以只总结前8点;只有真正对论文感兴趣且想要follow的时候再总结下面的9. 这篇论文最脆弱的假设是什么?10. 如果我有1周时间,能做一个最小复现实验验证它的哪一点?11. 如果我反对它,我会怎么设计反例?12. 调研、思考、基于你的信息提出一个follow up的idea,要novel,不是增量研究,是从方法缺陷Limitation和需求出发思考可能的新的有价值的研究#【建议(注意删掉这个注释)】:下面内容是可选的,如果没有要求可以删除,节省上下文和搜索开销要求:* 风格参考Andrej Karpathy和Kaiming He,要求有真人的语感* 使用详细的、准确的claim,每句话都要有信息量,避免大空话和泛泛而谈* 使用流畅的文本,避免滥用破折号、引号,保持输出内容清洁流畅,易读性高* 使用真人逻辑,避免使用[不是...而是]这种AI的低信息量结构* 请严格区分四类信息:论文原文明确声称的内容、相关文献中的已有结论、基于证据的合理推断、仍然不确定的猜测。不要把推断写成事实。
02 作者评价
接下来,我们将对这些项目的特点进行评价,并给出使用建议。
1 evil-read-arxiv
evil-read-arxiv 文献精读模块
首先是 evil-read-arxiv,这个项目像一条已经铺好的流水线。它能从检索和每日推荐一路做到单篇分析、插图提取和知识图谱,长期追踪某个方向时很省事。
但如果想要完整发挥它的潜力,需要的准备工作不少:如果需要完整发挥功能,Python依赖、Obsidian 路径、配置文件都要理顺,Web 端还会继续增加 Node 和 API 配置。
若你
只是临时读一篇 PDF,这套系统略显沉重;一旦准备经营自己的论文库,它的优势才会逐渐显出来。
2 DeepPaperNote
接下来是 DeepPaperNote,这个项目的边界最清楚:一次认真处理一篇论文,再把结果放进可继续生长的 Obsidian 笔记。它既保留公式、数字和图表语境,也愿意在材料不够时停下,因此成品更像“以后还会回来看的笔记”。此外,它的安装比前一款简单,Codex 等多个宿主都有明确支持。
但是它不负责每日推荐或大规模追热点,也不适合同时精读多篇文献。连续处理几十篇时,仍需你另外规划检索、去重与专题综述。
3 PaperForge
PaperForge 输出的结果可以与你原来的版本取长补短。
最后是PaperForge,他的长处在于能帮你重建思路、追问假设、做最小复现和设计反例,这几步对真正准备跟进一篇论文的人很有价值;而且,即使不安装 Skill 也能直接用 System Prompt。
它的缺点也来自于它最大的优势:如果选择让项目输出完整的 12 节,完整阅读依然要花很多时间;此外,这个项目更偏理工科和重实验论文,人文社科需要再按学科修改框架;最后,他也没有 DeepPaperNote 那么完整的材料整理与笔记落库流程。
小编推荐:DeepPaperNote
综合功能边界、安装成本、平台支持和后续复用,我会先推荐 DeepPaperNote。
它没有把检索、推荐、知识图谱和选题全塞进来,反倒守住了“把一篇论文读明白并留下可靠笔记”这件事。新生可以用它建立第一套阅读模板;已经在做课题的人,也能把笔记直接接入 Obsidian、Zotero 或后续综述。
此外,如果你所追求的更加全面,要经营自动化论文库,也可以考虑转向 evil-read-arxiv。还有余力的话,可以把 PaperForge 也接到后面,再检查一遍有没有遗漏内容,组成一条完整的工作流。
03 实战演示
接下来,我们将演示如何从零开始,安装 DeepPaperNote
,并完成对一篇论文的精读。
这个 skill 的安装非常简单,只需在 Codex 里输入代码即可。
假设你刚拿到一篇包含模型结构、长公式和多组消融实验的论文。摘要读懂了,但你还说不清公式为何这样设计,也分不清主实验和补充实验分别回答了什么。这里,我们用 DeepPaperNote 做一张证据型阅读卡。
输入:
$deeppapernote 请把这篇论文整理成中文 Obsidian 深读笔记,供我下周组会使用。先完成材料检查:确认 PDF 文字层、页数、章节、公式和图表是否可读取;若关键页面缺失或解析失败,先报告问题。
正文按以下顺序组织:1. 用 150 字说明研究问题与作者的解决思路;2. 画出“输入—核心模块—输出”的方法链,并解释每个模块为何存在;3. 选择最重要的一条公式,逐项解释符号、假设及它与算法步骤的关系;4. 将每项核心结论对应到具体实验、页码和图表编号;5. 分开列出作者明示的局限、你基于证据提出的疑问;6. 给我留下 3 个组会上值得追问的问题。
不要把摘要换句话说。所有数字、公式和图表关系都要回到原文;无法确认处标为“待核对”。
比起一篇篇文献“生啃“,效率还是有巨大提升的。
尾声
读得快并不难,难的是几周后还能找到当时的判断依据。先挑一款工具,把“问题—方法—证据—局限”固定成自己的阅读习惯,再决定要不要加推荐、图谱或反例分析。
文献精读最终应该留下一份随时能回到原文的研究笔记,而不是再添一篇摘要。