Py学习  »  Git

从Github安装r packge-“”在当前工作目录中不存在

Kevin • 6 年前 • 1747 次点击  

我已经建立了一个新的包,它在GitHub上托管在 github.com/kevinwolz/hisafer .

我正在尝试通过devtools::install_github()安装该包,但我遇到了一个错误。帮助?

>install_github("kevinwolz/hisafer")

Downloading GitHub repo kevinwolz/hisafer@master
from URL https://api.github.com/repos/kevinwolz/hisafer/zipball/master
Installing hisafer

[这里,5个包依赖项(dplyr、tidyr、purr、ggplot2、lubridate)自动安装成功,但我遗漏了文本]

"C:/Users/wolzkevi/DOCUME~1/R/R-34~1.3/bin/x64/R" --no-site-file --no-environ --no-save  \
  --no-restore --quiet CMD INSTALL  \
  "C:/Users/wolzkevi/AppData/Local/Temp/Rtmpg5OyD6/devtools28843ed4c0a/kevinwolz-hisafer-bf69883"  \
  --library="C:/Users/wolzkevi/Documents/R/R-3.4.3/library" --install-tests 

* installing *source* package 'hisafer' ...
** R
** inst
** preparing package for lazy loading
Error : '' does not exist in current working directory ('C:/Users/wolzkevi/AppData/Local/Temp/Rtmpg5OyD6/devtools28843ed4c0a/kevinwolz-hisafer-bf69883').
Error : unable to load R code in package 'hisafer'
ERROR: lazy loading failed for package 'hisafer'
* removing 'C:/Users/wolzkevi/Documents/R/R-3.4.3/library/hisafer'
In R CMD INSTALL
Installation failed: Command failed (1)

这里的关键错误似乎是“错误:当前工作目录中不存在“””。有人知道为什么会这样吗?我的包的构建/设置方式是否导致了问题?如果不是从GitHub下载,我可以从源代码安装包,这样我就相信GitHub进程中发生了一些奇怪的事情。

会话信息:

R version 3.4.3 (2017-11-30)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows >= 8 x64 (build 9200)

Matrix products: default

locale:
[1] LC_COLLATE=French_France.1252  LC_CTYPE=French_France.1252   
[3] LC_MONETARY=French_France.1252 LC_NUMERIC=C                  
[5] LC_TIME=French_France.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] devtools_1.13.4

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] httr_1.3.1     compiler_3.4.3 R6_2.2.2       tools_3.4.3    withr_2.1.1    curl_3.1      
 [7] memoise_1.1.0  knitr_1.19     git2r_0.21.0   digest_0.6.15 
Python社区是高质量的Python/Django开发社区
本文地址:http://www.python88.com/topic/30520
 
1747 次点击  
文章 [ 1 ]  |  最新文章 6 年前
duckmayr
Reply   •   1 楼
duckmayr    6 年前

问题在于 R/utils.R ,您尝试从中读取文件 inst/extdata 不存在(来自第36行和第37行):

INPUT.DEFS  <- readr::read_delim(system.file("extdata", "input_defs.txt",  package = "hisafer"), "\t", col_types = readr::cols())
OUTPUT.DEFS <- dplyr::arrange(readr::read_delim(system.file("extdata", "output_defs.txt", package = "hisafer"), "\t", col_types = readr::cols()), profile, name)

检查 内部/外部数据 也不会给你看 input_defs.txt 也不 output_defs.txt 有。

我怎么知道的?

我跑

devtools::load_all("hisafer/")

也会产生错误

错误:当前工作目录中不存在“”。

但允许您显示信息性的回溯:

13.stop("'", path, "' does not exist", if (!is_absolute_path(path)) paste0(" in current working directory ('", 
    getwd(), "')"), ".", call. = FALSE) 
12.check_path(path) 
11.standardise_path(file) 
10.read_delimited(file, tokenizer, col_names = col_names, col_types = col_types, 
    locale = locale, skip = skip, comment = comment, n_max = n_max, 
    guess_max = guess_max, progress = progress) 
9.readr::read_delim(system.file("extdata", "input_defs.txt", package = "hisafer"), 
    "\t", col_types = readr::cols()) at utils.R#36
8.eval(exprs[i], envir) 
7.eval(exprs[i], envir) 
6.source_one(file, envir = envir) 
5.source_many(paths, env) 
4.force(code) 
3.withr_with_dir(file.path(pkg$path), source_many(paths, env)) 
2.load_code(pkg) 
1.devtools::load_all("hisafer/") 

注意回溯中的9号,它不仅显示了有问题的代码,而且还帮助显示了它来自哪个文件以及在哪个行上。

问题的根源:你的 .gitignore

在你 吉蒂格诺 你有台词

inst/extdata/
inst/extdata/*

这意味着中的所有文件和子文件夹 inst/extdata/ 不会被跟踪,因此当用户尝试从GitHub安装时,他们不会获得 extdata/ 它们需要的文件才能使您的包正常工作。

作为旁注,即使用户下载您的回购并手动添加 输入输出 输出命令 ,由于同样的原因,它们没有您希望它们拥有的其他模板目录,因此构建vignette会导致安装错误。