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安徽农业大学基于深度学习与靶向代谢组学实现茶树咀嚼式害虫的监测及防御化合物筛选

植物科学最前沿 • 1 年前 • 246 次点击  

近日,Plant Cell & Environment在线发表了安徽农业大学茶树生物学与资源利用国家重点实验室夏涛课题组的题为Deep learning and targeted metabolomics‐based monitoring of chewing insects in tea plants and screening defense compounds的研究论文。该研究结合深度学习与靶向代谢组学用于监测茶园中茶树冠层水平受咀嚼式害虫为害的损伤程度,并从中筛选出潜在的防御性化合物,随后对可能的防御性化合物合成的相关基因做了功能分析,该研究为有效监测茶树害虫为害程度及筛选绿色防御化合物提供了重要的参考价值和应用前景。


为了有效识别茶树冠层水平的小目标损伤以及实现模型的高性能,课题组首先基于TPH-YOLOv5算法对上千个数据集进行了模型训练,最终构建了一个茶树冠层水平小目标损伤的监测模型,通过将人工标记图像的结果与模型预测的结果进行比较发现该模型在识别茶树冠层水平损伤上是可能的。
1 基于TPH-YOLOv5的茶树冠层损伤检测模型的建立

随后,使用该模型对茶园中不同茶树品种的冠层水平损伤程度进行统计和比较,结合靶向代谢组学,利用OPLS对酚类代谢物进行聚类,并分析了损伤程度与代谢物之间的相关性,从中筛选出一种潜在的防御性化合物—EC-CA

 

2 利用模型预测不同茶树品种的损伤程度并使用OPLS筛选差异化合物

为了探索茶树咀嚼式害虫对EC-CA是否具有拒食效果,分别将表儿茶素的羟基肉桂酰基化产物EC-CA、没食子酰基化产物ECG以及底物EC分别涂抹到茶树叶片表面,各自引入灰茶尺蠖比较它们的取食情况,结果显示相比较ECGEC,灰茶尺蠖对EC-CA具有更明显的拒食性。这就表明EC-CA对茶树咀嚼式害虫具有一定的抑制效果。

 

3  分别用EC‐CAECGEC处理 茶树叶片比较灰茶尺蠖的拒食性

那么EC-CA是怎么合成的?根据文献报道,BAHD酰基转移酶家族Vb分支成员HCTs具有底物混杂性,可以催化羟基、胺基形成酯或者酰胺等物质,由此推测其也可以催化表儿茶素的羟基肉桂酰基化形成EC-CA。组织表达差异与诱导表达差异也显示CsHCTsEC-CA的积累模式一致。随后的体外酶学实验表明CsHCTs的确可以有效催化EC-CA的合成。通过基因的反义寡核苷酸实验表明咖啡酰莽草酸、绿原酸和表儿茶素咖啡酸酯都是CsHCTs的产物。

 

4 羟基肉桂酰基转移酶(HCT)(BAHD家族的一员)催化EC的羟基肉桂酰基化合成EC‐CA

最后,通过农杆菌介导的茶树叶片瞬时遗传转化实验分别将对照及含有目的基因的农杆菌注射到茶树枝条中,比较灰茶尺蠖对它们的取食情况,结果显示瞬时过表达CsHCTs的茶树叶片相应的三种产物含量均增加,且受到灰茶尺蠖的取食更少,这表明瞬时过表达CsHCTs的茶树叶片对灰茶尺蠖具有一定的抵抗效果。

 

5 灰茶尺蠖对瞬时过表达CsHCT2的茶树叶片表现出更明显的拒食行为

安徽农业大学茶树生物学与资源利用国家重点实验室陈一凡博士为本论文的第一作者,夏涛教授和高丽萍教授为共同通讯作者。相关工作得到国家自然科学基金以及国家重点研发计划的支持。


文章链接:
https://doi.org/10.1111/pce.14749





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