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目录 Catalogue
Nature Weekly
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1. Control of neuronal excitation–inhibition balance by BMP–SMAD1 signalling
(BMP-SMAD1信号通路对神经元兴奋-抑制平衡的控制)
2. Promiscuous G-protein activation by the calcium-sensing receptor
(钙感知受体活化混杂G蛋白)
3. Streptomyces umbrella toxin particles block hyphal growth of competing species
(链霉菌伞状毒素颗粒阻断竞争菌种菌丝生长)
4. Machine learning reveals the control mechanics of an insect wing hinge
(机器学习解释昆虫翅膀铰链的控制机制)
5. Brain endothelial GSDMD activation mediates inflammatory BBB breakdown
(大脑内皮GSDMD的激活介导炎症性血脑屏障损伤)
6. Network-level encoding of local neurotransmitters in cortical astrocytes
(皮层星形胶质细胞局部神经递质的网络水平编码)
7. Control of working memory by phase–amplitude coupling of human hippocampal neurons
(人类海马神经元相幅耦合对工作记忆的控制)
8. Stepwise activation of a metabotropic glutamate receptor
(代谢型谷氨酸受体的逐步激活)
9. DNA glycosylases provide antiviral defence in prokaryotes
(DNA糖基化酶在原核生物中提供抗病毒抵御)
10. Multimodal cell atlas of the ageing human skeletal muscle
(衰老人类骨骼肌的多模态细胞图谱)
Science Weekly
1. Phage predation, disease severity, and pathogen genetic diversity in cholera patients
(霍乱患者的噬菌体捕食、疾病严重程度和病原体遗传多样性)
2. Drugs of abuse hijack a mesolimbic pathway that processes homeostatic need
(药物滥用会操纵稳态维持所需的中脑缘通路)
3. Generalized biomolecular modeling and design with RoseTTAFold All-Atom
(基于RoseTTAFold All-Atom的生物分子建模与设计)
4. A naturally isolated symbiotic bacterium suppresses flavivirus transmission by Aedes mosquitoes
(一种自然分离的共生菌抑制伊蚊传播的黄病毒)
5. Neuroendocrine cells initiate protective upper airway reflexes
(神经内分泌细胞启动保护性上呼吸道反射)
Cell Weekly
1. Dual-role transcription factors stabilize intermediate expression levels
(双重角色转录因子稳定中间表达水平)
2. Integrative spatial analysis reveals a multi-layered organization of glioblastoma
(综合空间分析揭示胶质母细胞瘤的多层构造)
3. BCAA-nitrogen flux in brown fat controls metabolic health independent of thermogenesis
(褐色脂肪中的BCAA-氮通量独立于产热控制代谢健康)
4. Evasion of NKG2D-mediated cytotoxic immunity by sarbecoviruses
(类SARS冠状病毒逃逸NKG2D介导的细胞毒性免疫)
5. Gut symbionts alleviate MASH through a secondary bile acid biosynthetic pathway
(肠道共生体通过次级胆汁酸生物合成途径缓解MASH)
6. Alanyl-tRNA synthetase, AARS1, is a lactate sensor and lactyltransferase that lactylates p53 and contributes to tumorigenesis
(Alanyl-tRNA合成酶AARS1是一种乳酸感受器和乳酸转移酶,能够使p53乳酸化并促进肿瘤发生)
Weekly Highlights
大脑内皮GSDMD的激活介导炎症性血脑屏障损伤
血脑屏障可以保护中枢神经系统免受感染和侵害,其损伤可导致或加剧中枢神经系统的各类疾病。在此之前,感染和炎症导致血脑屏障受损的机制并不清楚。本文发现胞质感知LPS的caspase-11活化的打孔蛋白GSDMD(而非TLR-4诱导的细胞因子)在响应循环的LPS时或在LPS诱导的败血症期间介导血脑屏障损伤。单细胞RNA测序分析发现,高表达GSDMD脑内皮细胞(bEC)对循环LPS有显著反应。小鼠基因综合分析结合bEC靶向腺相关病毒系统确定了bEC中的GSDMD激活是LPS破坏血脑屏障的基础。活性GSDMD传递至bEC绕过了LPS的刺激并打开了血脑屏障。该研究概述了炎症性血脑屏障损伤的机制,并为与之相关的中枢神经系统疾病提供了潜在的治疗方法。
DNA糖基化酶在原核生物中提供抗病毒抵御
细菌通过进化出各种各样的防御系统来适应噬菌体的捕食。通过利用裂解大肠杆菌T4噬菌体感染携带土壤宏基因组DNA文库的大肠杆菌,该研究分离了携带保护基因的克隆,并鉴定了Brig1,一种DNA糖苷酶。它从T4噬菌体基因组中切割α-葡糖基-羟甲基胞嘧啶核碱基,产生碱基位点并抑制病毒复制。Brig1同源物可提供对T-偶数噬菌体的抵御力,且存在于不同细菌分支的多个噬菌体防御基因座中。该研究强调了筛选未测序DNA的意义,并揭示了原核DNA糖基化酶是细菌-噬菌体军备竞赛中的重要参与者。
基于RoseTTAFold All-Atom的生物分子建模与设计
近年来,机器学习的进步使蛋白质结构预测和设计变得更加准确和容易,但这些工具通常仅限于多肽链。然而,小分子、金属离子和核酸等配体在结构和生物功能方面都是大多数蛋白质的关键成分。Krishna等人提出了下一代蛋白质结构预测和设计工具RoseTTAFold All Atom,它可以接受广泛的配体和共价氨基酸修饰。与其他工具相比,即使在没有输入实验结构的情况下,作者在蛋白质配体结构预测方面也表现出了优越的性能。他们还对蛋白质进行了从头设计,以结合辅因子和小分子,并通过实验验证这些设计。
饮食与药物滥用
药物滥用会破坏大脑固有的正常处理自然奖励的功能。然而,连接这些功能的潜在生理和分子机制仍不清楚。Tan等人将同一动物对饥饿和口渴激活的关键奖励回路的响应与吗啡和可卡因的反应进行了比较。他们发现,哺乳动物雷帕霉素靶点的信号伴侣RHEB蛋白(大脑中富集的Ras同源物)是一种关键的分子底物,使药物能够进入处理自然奖赏的神经元。这种分子机制与大脑中称为伏隔核的区域内的可分离神经元群有关。这些神经元群是药物成瘾效应的中心,在这里,药物摄入和饥饿口渴的稳态调节发生了冲突。
双重角色转录因子稳定中间表达水平
精确控制基因表达水平对正常细胞功能至关重要,但如何定义和严格维持基因表达水平,尤其是在中间水平,仍然难以捉摸。在这里,使用一系列新开发的测序、成像和功能测定,我们发现了一类具有激活剂和阻遏物双重作用的转录因子,称为凝聚物形成水平调节双重作用转录因子(TF)。它们减少高表达,但增加低表达以达到稳定的中间水平。双重作用的转录因子通过选择性划分核心转录单元的凝聚物形成结构域直接发挥激活和抑制功能。这些结构域的临床相关突变与一系列发育障碍有关,损害了凝聚物的选择性和双重作用TF活性。这些结果共同解决了表达调控中的一个基本问题,并证明了水平调控双重作用转录因子作为工程控制表达水平的强大效应物的潜力。
褐色脂肪中的BCAA-氮通量独立于产热控制代谢健康
棕色脂肪组织(BAT)以产热而闻名。啮齿动物研究表明,BAT产热增强与能量消耗增加、体重减轻和葡萄糖稳态改善密切相关。然而,人类BAT对2型糖尿病具有保护作用,与体重无关。这种分离的机制尚不清楚。在此,该研究报道了BAT中支链氨基酸(BCAA)的线粒体分解代谢受损,通过删除线粒体BCAA载体(MBCs),在不影响能量消耗和体重的情况下可引起全身胰岛素抵抗。棕色脂肪细胞在线粒体中分解代谢BCAA,作为非必需氨基酸和谷胱甘肽生物合成的氮供体。BAT中线粒体BCAA氮通量受损导致氧化应激增加,肝脏胰岛素信号传导减少,循环BCAA衍生代谢产物减少。高脂肪饮食减弱了BAT中BCAA氮通量和代谢产物的合成,而冷激活的BAT增强了合成。这项工作揭示了一种代谢产物介导的途径,BAT通过该途径控制产热以外的代谢健康。
作者 | 张颖
责编 | 囡囡
设计 / 排版 | 可洲 雨萱
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