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pkg_resources 需要添加到 packages 名单 build_exe 选项:

build_exe_options = {'packages': ['pkg_resources']}

备注:可能需要在 包装 按安装脚本工作的顺序列出(这些条目在OP自己的答案中找到,但在问题的安装脚本中丢失)。